Hibridização e introgressão entre Cichla piquiti e Cichla ocellaris var. kelberi: evidências moleculares e morfométricas em ambientes nativo e não-nativo.

Nóbrega, Felipe de Souza Cruz

DSpace Home
→
Centro de Ciências Biológicas e da Saúde (CCBS)
→
Biociências
→
BIOC - Teses de Doutorado
→
View Item

dc.contributor.advisor	Salgueiro, Fabiano
dc.contributor.author	Nóbrega, Felipe de Souza Cruz
dc.date.accessioned	2026-09-10T11:01:26Z
dc.date.available	2026-09-10T11:01:26Z
dc.date.issued	2026-01-15
dc.identifier.citation	NÓBREGA, Felipe de Souza Cruz. Hibridização e introgressão entre Cichla piquiti e Cichla ocellaris var. kelberi: evidências moleculares e morfométricas em ambientes nativo e não-nativo. 2026. Tese (Doutorado em Ciências Biológicas (Biodiversidade Neotropical)) – Instituto de Biociências, Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro, 2026.	pt_BR
dc.identifier.uri	http://hdl.handle.net/unirio/15403
dc.description.sponsorship	FUNBIO, CNPq, FAPERJ	pt_BR
dc.language.iso	Portuguese	pt_BR
dc.rights	openAccess	pt_BR
dc.title	Hibridização e introgressão entre Cichla piquiti e Cichla ocellaris var. kelberi: evidências moleculares e morfométricas em ambientes nativo e não-nativo.	pt_BR
dc.title.alternative	Hybridization and introgression between Cichla piquiti and Cichla ocellaris var. kelberi: molecular and morphometric evidence in native and non-native environments.	pt_BR
dc.type	doctoralThesis	pt_BR
dc.contributor.advisor-co	Santos, Luciano Neves dos
dc.contributor.referee	Salgueiro, Fabiano
dc.contributor.referee	Paula, Joel Campos de
dc.contributor.referee	Fernandes, Maurício Romulo
dc.contributor.referee	Henning, Frederico
dc.contributor.referee	Jorge, Rafael Filgueira
dc.degree.department	CCBS	pt_BR
dc.degree.grantor	Universidade Federal do Estado do Rio de Janeiro - UNIRIO	pt_BR
dc.degree.local	Rio de Janeiro, RJ	pt_BR
dc.degree.program	Programa de Pós-Graduação em Enfermagem e Biociências	pt_BR
dc.subject.cnpq	Área: CIÊNCIAS BIOLÓGICAS. Subárea: BIODIVERSIDADE	pt_BR
dc.subject.en	Cichlids	pt_BR
dc.subject.en	Peacock bass	pt_BR
dc.subject.en	Geometric morphometrics	pt_BR
dc.subject.en	Invasive species	pt_BR
dc.subject.en	ddRAD-seq	pt_BR
dc.description.abstracten	Interspecific hybridization is a significant evolutionary process capable of influencing genetic diversity and the success of biological invasions. In the genus Cichla (peacock bass), hybridization is a natural phenomenon that is intensified by human action, particularly between Cichla piquiti and Cichla ocellaris var. kelberi, two species that naturally co-occur in the Tocantins-Araguaia basin and have been widely introduced into other systems. This thesis investigated the dynamics of hybridization and introgression between these species through an integrative approach, comparing populations in a native environment (Serra da Mesa reservoir) and a non-native environment (Três Marias reservoir). The structure of this work comprises a systematic review, genomic analyses via ddRAD-seq, and geometric morphometrics. In the first chapter, the literature review demonstrated that hybridization in Cichla is geographically and phylogenetically widespread in its native range, connecting distant species, but generally at low frequency. In contrast, in non-native environments, hybridization is favored, frequently resulting in hybrid swarms where genetic admixture is prevalent. In the second chapter, genome-wide SNP analysis revealed contrasting patterns of introgression. While the invasive population in Três Marias presented extensive hybridization with advanced backcrossing and high heterozygosity, the native population of Serra da Mesa, previously considered reproductively isolated, revealed signs of cryptic introgression. Furthermore, genomic cline analyses in the invasive population detected differential introgression, identifying 46 loci with excess C. piquiti ancestry, suggesting selective retention of specific alleles from this species despite predominant gene flow toward C. ocellaris var. kelberi. These results indicate that reproductive barriers between these species are semi-permeable and that gene flow, although subtle in the native environment, is exacerbated in the invasion context. Finally, the third chapter integrated genomic data with geometric morphometrics to assess the phenotypic consequences of admixture. A clear ecomorphological divergence was detected between the parental species. Hybrids exhibited strictly intermediate morphology, with no evidence of henotypic transgression. There was a strong correlation between body shape and the genomic hybrid index, demonstrating that phenotype is a reliable predictor of genetic ancestry in these populations. Taken together, the results suggest that hybridization between C. piquiti and C. ocellaris var.7 kelberi generates viable and functional phenotypes that, in altered or non-native environments, may contribute to the ecological success and persistence of these species.	pt_BR
dc.degree.country	Brasil	pt_BR
dc.description.sponsordocumentnumber	s/n	pt_BR
dc.description.abstractpt	A hibridização interespecífica é um processo evolutivo significativo, capaz de influenciar a diversidade genética e o sucesso de invasões biológicas. Em Cichla (tucunarés), a hibridização é um fenômeno natural, que é intensificado pela ação humana, particularmente entre Cichla piquiti e Cichla ocellaris var. kelberi, duas espécies que coocorrem naturalmente na bacia Tocantins-Araguaia e foram amplamente introduzidas em outros sistemas. Esta tese investigou a dinâmica da hibridização e introgressão entre estas espécies através de uma abordagem integrativa, comparando populações em ambiente nativo (reservatório de Serra da Mesa) e nãonativo (reservatório de Três Marias). A estrutura do trabalho compreende uma revisão sistemática, análises genômicas via ddRAD-seq e morfometria geométrica. No primeiro capítulo, a revisão bibliográfica demonstrou que a hibridização em Cichla é geográfica e filogeneticamente disseminada em sua área nativa, conectando espécies distantes, mas geralmente em baixa frequência. Em contraste, em ambientes introduzidos, a hibridização é favorecida, resultando frequentemente em enxames híbridos onde a mistura genética é prevalente. No segundo capítulo, a análise de SNPs em escala genômica revelou padrões contrastantes de introgressão. Enquanto a população invasora em Três Marias apresentou extensa hibridização com retrocruzamentos avançados e alta heterozigosidade, a população nativa de Serra da Mesa, anteriormente considerada reprodutivamente isolada, revelou sinais de introgressão críptica. Além disso, análises de clinas genômicas na população invasora detectaram introgressão diferencial, identificando 46 loci com excesso de ancestralidade de C. piquiti, o que sugere a retenção seletiva de alelos específicos desta espécie apesar do fluxo gênico predominante em direção a C. ocellaris var. kelberi. Esses resultados indicam que as barreiras reprodutivas entre estas espécies são semipermeáveis e que o fluxo gênico, embora sutil no ambiente nativo, é exacerbado no contexto da invasão. Por fim, o terceiro capítulo integrou os dados genômicos à morfometria geométrica para avaliar as consequências fenotípicas da mistura. Foi detectada uma divergência ecomorfológica clara entre os parentais. Os híbridos exibiram morfologia estritamente intermediária, sem evidências de transgressão fenotípica. Houve uma forte correlação entre a forma do corpo e o índice híbrido5 genômico, demonstrando que o fenótipo é um preditor confiável da ancestralidade genética nestas populações. Em conjunto, os resultados sugerem que a hibridização entre C. piquiti e C. ocellaris var. kelberi gera fenótipos viáveis e funcionais que, em ambientes alterados ou invadidos, podem contribuir para o sucesso ecológico e a persistência destas espécies.	pt_BR
dc.subject.pt	Ciclídeos	pt_BR
dc.subject.pt	Tucunaré.	pt_BR
dc.subject.pt	Morfometria geométrica	pt_BR
dc.subject.pt	ddRAD-seq	pt_BR
dc.subject.pt	Espécies invasoras	pt_BR
dc.subject.decs	Ciclídeos	pt_BR
dc.subject.decs	Espécies Introduzidas	pt_BR